Nemo, intrépide petit poisson-clown, a été capturé par des plongeurs. Son père, Martin, remue ciel et mer pour le retrouver.
Mais le chemin est long et semé d'embûches jusqu'à Sydney où Nemo est enfermé dans un aquarium. Marin, accompagné de son amie Dory, et Nemo, entouré de la bande des Siphonnés du Bocal, pourront-ils, grâce à leurs efforts, être de nouveau réunis ?